מתחקיר ניו יורק טיימס עולה כי במרץ 2023 השתכנע נתניהו לאחר שיחה עם ראש המוסד, דוד ברנע, כי הביפרים חסינים ואינם עלולים להישבר, המוסד שלח את הסחורה הראשונה של הביפרים לחיזבאללה.
באוקטובר 2023 מנתחי מודיעין ישראלים, שעקבו כל העת אחר השימוש במכשירים, גילו בעיה אפשרית במבצע. לפחות טכנאי חיזבאללה אחד החל לחשוד שמכשירי הקשר עשויים להכיל חומרי נפץ חבויים, לפי שלושה גורמי ביטחון ישראלים. ישראל טיפלה בזה במהירות עוד השנה, והרגה את הטכנאי בתקיפה אווירית.
במשך כמעט שנה, המודיעין הישראלי וחיל האוויר ניהלו כ-40 תרגילי מלחמה שנבנו סביב חיסול נסראללה ומנהיגים בכירים אחרים בחיזבאללה, אמרו שני גורמים ישראלים.
בסוף אוגוסט כתב ברנע מכתב חשאי לנתניהו, שדגל ביציאה למערכה של שבועיים-שלושה, שכללה חיסול של יותר ממחצית מיכולות הטילים של חיזבאללה והשמדת מתקנים. במקביל, גורמים בכירים בצבא החלו במאמץ משלהם לעודד את נתניהו להגביר את המערכה נגד חיזבאללה.עם זאת, מידע מודיעיני חדש שיבש את התכנון. גורמים רשמיים טענו בתחקיר כי פעילי חיזבאללה חשדו כי ניתן לחבל באיתור הביפרים. ב-11 בספטמבר זיהה המודיעין כי חיזבאללה שולח חלק מהביפרים לאיראן לבדיקה, וגורמים רשמיים ישראלים ידעו שזה רק עניין של זמן עד שהמבצע החשאי יתפוצץ.ב-16 בספטמבר, נתניהו נפגש עם ראשי הביטחון הבכירים כדי לשקול האם לפוצץ את האימונים בפעולת "השתמש בזה או לאבד את זה", לפי ארבעה גורמי ביטחון ישראלים. חלקם התנגדו לכך, ואמרו שזה עשוי לעורר מתקפת נגד מלאה של חיזבאללה ואולי למתקפה של איראן.
נתניהו הורה על המבצע. למחרת, בשעה 15:30 שעון מקומי, הורה המוסד לשלוח הודעה מוצפנת לאלפי ביפרים. שניות לאחר מכן הם כבר התפוצצו על פניהם של עשרות בני אדם, ברובם פעילי חיזבאללה.
לאחר מכן, במודיעין התקבל מידע חדש לפיו נסראללה מתכנן לעבור לבונקר אחר, כזה שיהיה הרבה יותר קשה לפגיעה בו. ב-26 בספטמבר, עם כוונתו של נתניהו לטוס לניו יורק לעצרת האו"ם, התכנס ראש הממשלה עם יועציו המדיניים, המודיעיניים והצבאיים הבכירים כדי לדון באישור חיסולו של נסראללה.
נתניהו אישר את החיסול למחרת, לאחר שנחת בניו יורק ושעות בודדות לפני שעמד על הדוכן באו"ם.
גורמים מודיעיניים חשפו כעת כי בעוד נסראללה היה מוחבא בתוך בונקר חיזבאללה 40 רגל מתחת לאדמה במהלך יום החיסול, ה-27 בספטמבר, עוזריו דחקו בו ללכת למקום בטוח יותר.
פרטי מודיעין חדשים מגלים כי נסראללה הגיב בביטול להמלצתם וכי הוא סבר שלישראל לא היה עניין במלחמה בקנה מידה מלא. מה שנסתר מעיניו היה שישראל כבר עקבה אחר תנועתו במשך עשרות שנים. למחרת, גופתו של נסראללה נמצאה במעין תנוחת חיבוק לצד גנרל איראני בכיר שבסיסו בלבנון. שניהם מתו מחנק, כך על פי ממצאי המודיעין.
לפי מקורות בעיתון "אל ערביה", איראן לא סומכת על חיזבאללה שיחקור היטב את הנסיבות שהובילו לפיצוץ הביפרים ומכשירי הקשר, ושלחה משלחת לביירות שתפקידה לחשוף ניסיונות לחבל באספקת ציוד רדיו.
