ירדן ביבס עבר תלאות בשבי שכלל תנאים קשים וטרור פסיכולוגי מצד שוביו. עדויות שפורסמו הערב (שני) בחדשות 12 מעלות כי ביבס הוחזק בתא במנהרה לבדו, והוצא ממנו רק פעם ביום כדי לאכול עם חטופים אחרים. המחבלים סירבו לאפשר לו לשהות עם חברו מהקיבוץ, והוא ירד כ-15 ק"ג ממשקלו.
ירדן ראה את חברו מקיבוץ ניר עוז חולף במנהרה. הוא ביקש מהמחבלים להישאר איתו, על מנת שהם יוכלו לתמוך זה בזה – אך מחבלי חמאס סירבו, והדבר הקשה עליו מאוד.
הוא הוחזק בהתחלה בתא קטן בנפרד מחברי ניר עוז. הוא הולבש בגלבייה, וניתן לו לצאת מהתא רק פעם ביום כדי לאכול עם חטופים אחרים. בחלק מהזמן לא היה אוכל, וביבס ירד כ-15 ק"ג ממשקלו.
ירדן חשב ששירי אשתו וילדיו אריאל וכפיר נשארו בבית וניצלו. הוא ניסה לוודא זאת עם המחבלים שוב ושוב – מדי יום, מדי שעה. עד שהחליטו לשקר ואמרו לו ששירי והילדים נצפו בתל אביב..
המחבלים דרשו מאחת החטופות לספר לירדן על שירי והילדים. היא סירבה, ולאחר מכן חטוף אחר נאלץ בקול רועד ובבכי לעדכן את ירדן שהם מתו. המחבלים האכזריים תיעדו אותו ברגעיו הקשים כשהוא ממררר בבכי.