ברקע האיומים הקיצוניים של בכירי המשטר האיראני צה"ל העלה את הדריכות והכוננות לקראת אפשרות של תגובה איראנית לתקיפה הישראלית. הכוננות באה לידי ביטוי בהערכות מצב יומיות בכלל הזרועות והאגפים במטכ"ל כולל פיקוד העורף, איסוף מודיעין במספר רב של שיטות בשילוב כלל קהילת המודיעין, כוננות גבוהה של חיל האוויר בדגש על מערך הבקרה ומערך ההגנה האווירית.
בנוסף לנוכחות של מאות חיילים אמריקאיים בישראל שמפעילים את מערכת ההגנה מפני טילים מסוג "תאאד" מתקיים קשר הדוק בין צה"ל לכוחות האמריקאיים שמוצבים בישראל. בנוסף לכך, סגן הרמטכ"ל האלוף אמיר ברעם מהדק את הקשר של שיתוף הפעולה עם מקביליו במפקדת סנטקום בצבא ארה"ב כדי להיערך לשלל התרחישים.
גורמים בצה"ל הבהירו כי חרף פרסומים שונים בכלי התקשורת הזרים אין ידיעה על מועד מדויק של התגובה, וכי קיימת הערכה שהאיראנים עדיין בוחנים את דרכי התגובה ושוקלים את עוצמתה. בצה"ל לא מוציאים מכלל אפשרות תגובה איראנית מסוריה, תימן ועיראק ולא בהכרח מאיראן בצורה ישירה. כמוכן, במערכת הביטחון לא פוסלים את האפשרות שהאיראנים ינסו להתנקש בחיי בכירים ישראלים בארץ ובחו"ל.
גורמים במערכת הביטחון העריכו היום כי האיראנים לוקחים בחשבון את האזהרות האמריקאיות ובוחנים את הגבול מול ארה"ב שבימים אלו נדרכה לתקופת בחירות. ניתן להעריך כי תקיפה איראנית בישראל עשויה להשפיע על הבחירות בארה"ב מאחר וישראל היה משולבת היטב בקמפיינים הפוליטיים של הדמוקרטים והרפובליקנים.
גורמי צבא אישרו כי צה"ל תגבר נקודתית מספר מערכים בתחום הגילוי להתרעה, הגנה אווירית, מודיעין והמבצעים במטכ"ל חרף הערכות כי הבחירות בארה"ב עשויות לדחות לפחות בימים את התגובה האיראנית.
